Една от най-големите загадки на археологията са тринадесетте кристални черепа. Според пророчеството, когато всички те бъдат събрани на едно място, човечеството ще разбере как да избегне апокалипсиса, предсказан ни в древния календар на маите. В Мексико и част от Централна и Южна Америка вече са открити няколко перфектни кристални черепа, не по-малко тайнствени и неразбираеми от Големите пирамиди или Стоунхендж.
Филмът проследява историята на тези удивителни артефакти -- митовете и легендите, които ги заобикалят, противоречивите теории за техния произход и предназначение, както и научният тест, на който тайно са подложени.